本系強調基礎課程與通識課程之重要性，並重視專業課程之整合性與應用性。且為滿足學生對於醫務管理課程求知慾望，開設課程非常多元且理論與實務課程兼顧，醫務管理相關之課程由眾多專任教授或知名兼任教授開課供學生求知之所需，以培養全方位之醫管人才。

醫學導論、藥學概論、公共衛生學、解剖生理學、病理管理、流行病學導論、醫用微生物學、醫務管理實習、醫務管理專題研究等。

程式設計、資料結構、資料庫管理、系統分析與設計、醫療計量學、管理資訊系統、電子病歷學、醫學資訊、醫學資料倉儲、醫學影像處理等。

醫務管理學、醫療經濟學、醫療成本分析、醫院財務管理學、健康保險學、醫院績效管理、管理會計學、醫院資財管理、醫療行銷學等。

　　課程的主軸可分為兩學程：資訊學程與管理學程。若修習了資訊學程，則具備了一般資訊管理學系之基礎核心的知識，對於日後從事醫療資料庫系統的建構、醫學資訊網路的建構等方向，極為有利。若修習了管理學程的課程，則具備了一般管理學系的核心知識，有助於學生未來服務於醫療保健相關的廠商，如醫療院所、療養院、連鎖藥局、藥商公司、醫療資訊網路、與醫療保健器材廠商等。

　　本系在課程規劃上，是透過以下的架構授課。在大一、二時，我們透過基礎知識學習來鞏固。之後，根據您想走的專精，會在大二、三開始學習更專精的內容，而在大三時，就會陸陸續續有實習相關的機會。

　　如上所說，本系在學習上分成了醫療資訊與健康管理兩大組別。雖然在基礎學習上，兩者所學幾乎無異，但在後續的專業課上有著極大的差距。

　　本系的課程大致分為：校必修、基礎必修、專業必修和專業選修四種類型。校必修是依照學校制定的規定所設置，旨在提升學生的基本素養；而基礎必修則是在前往醫療資訊專精和健康管理專精的路上必不可少的基礎知識與涵養，涉略醫療、資訊、管理，正和本系的名稱「醫療資訊與管理學系」無任何相異；專業必修則是根據您所選的專業會有不同類型的課程選擇；專業選修也和專業必修是一樣的，只是學生可以再透過自身未來的職業規劃或對該課程興趣與否選擇是否參與該課程。